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RNA 數位定量新標準 NanoString nCounter Analysis System



因表現量的比較分析已普遍應用於生科基礎研究與臨床診斷,目前基因表現分析平台常見的有即時定量聚合酶連鎖反應 (qPCR)、生物晶片與次世代定序法。然而,這些技術確面臨無法兼具高通量與高靈敏度的問題,以及對石蠟包埋樣本無法準確地檢測。為了能改善目前的技術瓶頸,NanoString開發出獨特的技術原理,提供多基因表現分析平台,且靈敏度可高達 0.5 fM,不需反轉錄與聚合酶連鎖反應,更適合應用於臨床石蠟包埋樣本。

「以前的樣本、今天的數據、明天的文章」

臨床上最容易獲得的檢體為石蠟包埋組織,但相對於DNA,RNA 較為敏感,容易受環境因素影響,造成 RNA 降解,以及福馬林也會抑制酵素的反應,使得 RNA 的研究材料常侷限於新鮮組織或細胞株。 NanoString nCounter 技術的實驗過程中,完全沒有酵素參與反應,且採用雙探針獨特設計,可高專一性地直接辨認 RNA,並進行數位化定量,對於石蠟包埋檢體皆可準確地偵測。不再需要漫長等待病人的新鮮檢體,可快速完成臨床回溯性研究與臨床伴隨式診斷試劑之開發。

「技術特點與應用」

📷🏅實驗精準: 經實驗證實,取同一份 RNA 樣本,進行多基因表現的定量,其決定係數 (R Square) 高達 0.99 以上,因此對於珍貴的臨床樣本,無須再做技術重覆。

📷🏅操作方便: 搭載全自動化樣本處理設備與掃描系統,手動操作時間僅 15 分鐘,24 小時內即可得到 19,200 個數據點。自動化流程,適合應用於臨床檢測平台。

📷🏅實驗彈性: NanoString 已針對多種研究領域開發出多種的多基因檢測套組,例如腫瘤免疫、神經退化疾病、癌症 Pathway 與轉移研究、自體免疫疾病等,供研究人員快速進行實驗。除市售套組外,另提供客製化服務,可根據自己的研究需求,開發專屬的檢測套組。

📷🏅應用範圍: 多基因表現量的比較分析、生物晶片或次世代定序結果驗證、伴隨式診斷套組開發、臨床回溯性研究。

「成功實例分享」

📷🥇Prosigna 乳癌復發風險評估套組: Perou 等研究團隊於 2000 年發表了不同乳癌分型的基因表現特徵,至 2009 年進一步篩選出 50 個具有代表性的基因組來反應不同分型的基因表現特徵,稱之為 PAM50。2010 年NanoString 購買 PAM50 專利,並於3年內完成 3000 多個臨床石蠟包埋樣本,2013 年 Prosigna 成功通過美國 FDA 認證並上市,為乳癌臨床診斷提供個人化的醫療方案,提升癌症的治癒率。

📷🥇默克 Keytruda 用藥反應研究: Merck 與 NanoString 合作,客製化 400-680 個基因,針對多種癌症對 Keytruda 藥物反應進行探討。最後成功找出18個基因,可有效預估對 Anti-PD-1 藥物有反應的基因組合,此研究成果並發表於 2017 年 JCI 學術專刊中。

NanoString 「RNA 數位定量新標準」勢必對基因表現量的比較分析帶來全新的風貌,更對臨床檢測開發有很大的幫助。官網:http://www.csbiotech.com.tw/index.php?action=proc_info&id=38 原文來源:基因線上(Geneonline) goo.gl/4D2ZHj

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